DNA barcoding

Met een DNA barcoding analyse testen we van welke soort een keutel of weefselmonster afkomstig is. Deze analyse is eenvoudig en resultaten kunnen we in vier weken opleveren. Wij maken hierbij gebruik van PCR en Sanger Sequencing.

Een DNA barcoding analyse kan uitsluitend uitgevoerd worden als er DNA van slechts één soort in het sample aanwezig is. Als er DNA van meerdere soorten in het sample aanwezig is, dan kan het sequencing signaal meestal niet uitgelezen worden. In dat geval kan metabarcoding gebruikt worden om een soortenlijst te genereren. We hebben primers ontwikkeld die specifiek DNA van een bepaalde soortgroep kunnen detecteren. Bij een standaardanalyse van een keutel is het dus niet erg als er DNA van prooidieren in het sample aanwezig zijn. Deze worden immers niet gedetecteerd met soortgroep-specifieke primers. Er zijn honderden van dergelijk soort-groep specifieke primers voorhanden, bijvoorbeeld:

• Muizen;
• Vleermuizen;
• Roofdieren;
• Marterachtigen;
• Zoogdieren algemeen;
• Vissen;
• Amfibieën;
• Ongewervelden;
• Planten.