Laboratorium methoden

eDNA monitoring

Datura biedt eDNA monitoring aan, zowel voor aquatische als voor terrestrische soorten. Alle organismen laten sporen van DNA achter in de omgeving waar ze leven. Uniek eDNA (environmental DNA) van de doelsoort in een watersample toont de aanwezigheid van de doelsoort aan. Datura past diverse technieken toe om eDNA te detecteren.
De volgende technieken worden het meest gevraagd:

Soort-specifieke detectie (qPCR)

Soort-specifieke eDNA analyse is een snelle, relatief goedkope, zeer gevoelige methode om eDNA van een specifieke soort aan te tonen. De detectie vind plaats door middel van kwantitatieve PCR (qPCR).

Soortenlijst van een bepaalde soortgroep (metabarcoding)

Als er DNA van meerdere soorten in een sample aanwezig zijn, dan biedt een DNA metabarcoding analyse uitkomst. Met deze techniek testen we van welke soorten er DNA in het sample aanwezig is.

Voedselwebanalyses (combinatie van qPCR en metabarcoding)

Datura heeft een nieuwe eDNA techniek ontwikkeld. Met deze techniek analyseren we de samenstelling van het voedselweb op basis van het eDNA uit een watermonster. Een eDNA voedselwebanalyse geeft goed inzicht in de ecologische kwaliteit en functioneren van het watersysteem.

DNA identificatie

Datura voert DNA analyses uit om uitwerpselen en weefselmonsters te identificeren. Als een soort op basis van uiterlijke kenmerken moeilijk te determineren is, dan kan een DNA analyse uitkomst bieden.
Datura biedt drie type DNA identificaties aan:

DNA barcoding analyse

Een standaard identificatie analyse kan uitsluitend uitgevoerd worden als er DNA van slechts één soort in het monster aanwezig is. Met deze analyse testen we van welke soort een keutel of weefselmonster afkomstig. Deze analyse is eenvoudig en binnen enkele dagen uit te voeren.

DNA metabarcoding

Als er (mogelijk) meerdere soorten in het sample aanwezig zijn, dan biedt een metabarcoding analyse uitkomst. Met deze techniek testen we van welke soorten er DNA in het sample aanwezig is. Een metabarcoding analyse is complexer, en duurt daarom enkele weken.

Soort-specifieke DNA analyse

Als er meerdere soorten in het sample aanwezig zijn, maar je specifiek opzoek bent naar een bepaalde soort, dan kan een soort-specifieke analyse toegepast worden. De soort-specifieke analyse gebruiken we met name om vast te stellen of er noordse woelmuis DNA in een mengmonster van woelmuiskeutels aanwezig is.