Bodemleven

Bodemleven analyse

In de bodem bevindt zich een rijkdom aan soorten. Het bodemleven vervult allerlei essentiële taken zoals de afbraak van organisch materiaal, de omzetting van stoffen en het leveren van nutriënten aan planten en bomen. Het bodemleven vertelt veel over de processen die plaats vinden en dus over het functioneren van de bodem. Het is daarom nuttig om te weten welke organismen aanwezig zijn. Helaas zijn deze voor een groot deel niet te zien met het blote oog. Met behulp van DNA-technieken kunnen we de samenstelling van het bodemleven toch ontrafelen.

Bemonstering en versturen

Het is mogelijk om de monstername te laten uitvoeren door één van de monsternemers van Datura. Ook kun je ervoor kiezen om de bemonstering zelf uit te voeren. Bodemmonsters worden met een guts gestoken volgens een vast protocol. Monsterzakken kunnen hier besteld worden. De monsters dienen dezelfde dag per post opgestuurd worden naar Datura. Lukt dat niet, dan dient het monster in de vriezer bewaard te worden. Het is belangrijk dat het monster aangemeld is voordat deze verstuurd wordt. Dat kan via dit formulier. Zo weten wij of het monster in de koelkast (chemisch-fysische analyse) of in de vriezer (eDNA analyse) opgeslagen moet worden.

Laboratoriumanalyse

In het laboratorium analyseren we het DNA van het bodemleven. Dit DNA noemen we eDNA (environmental DNA). Zo kunnen we van duizenden soorten vaststellen hoeveel eDNA er in de bodem aanwezig is. Datura biedt meerdere type analyses aan. De meest gekozen analyse is een ‘Globale analyse micro-organismen & wormen. Er zijn echter ook andere type analyses mogelijk zoals een detailanalyse die zich richt op een bepaalde soortgroep.

Globale analyse micro-organismen & wormen

Met een globale analyse kan vastgesteld worden hoeveel eDNA er aanwezig is van schimmels, bacteriën, archaea, wormen, protozoa en andere kleine organismen met een celkern. De gedetecteerde organismen worden met deze methode doorgaans geïdentificeerd tot op genus of familieniveau. Dit is voldoende detailniveau om vast te kunnen stellen welke functie een bepaald organismen vervuld. Naast de hoeveelheden organismen per soort, geven we in het meetrapport ook aan of er veel of weinig eDNA gedetecteerd is van organismen die een bepaalde functie in de bodem hebben. Bijvoorbeeld of het organismen in staat is om stikstof vast te leggen, of de hoeveelheid eDNA van organismen die de bodemstructuur verbeteren. Een voorbeeldrapportage kan je hier vinden.

Detailanalyses micro-organismen of wormen

Het kan van belang zijn om in te zoomen op een bepaalde soortgroep. Vaak wordt deze analyse uitgevoerd in aanvulling op de globale analyse micro-organismen of wormen. Het detailniveau van deze analyse is nauwkeuriger. Organismen die met de globale analyse tot op genus of familie geïdentificeerd worden kunnen met deze analyse vaak tot op soort geïdentificeerd worden. Dit kan van belang zijn als je precies wilt weten welke schimmelsoorten er in de bodem leven. Er zijn detailanalyses beschikbaar voor onder andere wormen en schimmels.

Detailanalyse ongewervelden

Datura heeft een methode ontwikkeld waarmee ongewervelden gemeten kunnen worden met eDNA. Deze methode is niet kwantitatief zoals de brede analyse, maar resulteert in een lijst van soorten die aangetroffen zijn in de bodem. Datura biedt diverse analyses aan zoals een analyse van micro-arthropoden (oa springstaarten, mijten) en een analyse voor bodem gebonden insecten zoals (larven van) kevers en vliegen.